1999年、秋。 宇宙より飛来した無数の超極小機械群「ナノマシン」が、各国の主要兵器、軍事端末に侵入し増殖を始めた。 ナノマシンにより無人化した兵器群は、無差別に攻撃を繰り返し各国の主要都市は壊滅状態となった。 そして戦術核ミサイル誤射による全面核戦争の恐怖が世界を襲う！！

かろうじて"ナノマシン"の侵入を防いだ各国の部隊は無人兵器撲滅作戦の為に招集される。 だが全世界の兵器と戦うにはあまりにわずかな兵力であった。

・・・もはや奴等に対抗しうる手段は無いと思われたその時！！ 作戦本部は謎の通信を受電。上空には白く輝く６本の軌跡が…

｢こちら"ＳＴＲＩＫＥＲＳ"、これより敵中枢への攻撃を開始する！残存部隊の後方支援に期待する！｣

半世紀の歳月を経て、特殊部隊"ＳＴＲＩＫＥＲＳ"の新たな伝説が今始まる！